肖鵬、王亞琪：《中國式現代化背景下的财政基礎理論創新研究》《廈門大學學報》（哲學社會科學版），2023年第6期，第23-30頁。
肖鵬、代龍濤：《預算績效管理改革提升了地方政府行政績效了嗎》《财貿經濟》，2023年第10期，第5-21頁。
肖鵬、王亞琪：《公共服務質量、社會信任與企業稅收遵從》《現代經濟探讨》，2023年第9期，第1-12頁。
肖鵬、代龍濤：《财政補貼、稅收優惠與創新激勵：效應分析與政策啟示》《經濟與管理評論》，2023年第5期，第21-35頁。
肖鵬、王亞琪：《财政助力中國式現代化：内在機制與改革路徑》《山東财經大學學報》，2023年第2期，第5-23頁。
肖鵬、邵淑玲：《數字技術賦能預算管理提升财政治理效能——“預算管理一體化與數字财政”學術研讨會會議綜述》《經濟研究參考》，2023年第3期，第140-142頁。
肖鵬、王亞琪：《健全現代預算制度 助力經濟高質量發展——2022年全國财政工作視頻會議精神解讀》《财政監督》，2023年第3期，第13-16頁。
馬海濤、肖鵬：《借力預算管理一體化 提升财政管理水平》《行政管理改革》，2022年第8期，第30-37頁。
肖鵬、陶暢：《我國财政支出标準化存在的挑戰與對策——以中央本級項目支出定額标準體系建設為例》《财經智庫》，2023年第3期，第53-68頁。
馬海濤、肖鵬：《健全政府預算制度，持續提升政府治理效能》《光明日報》（理論版），2023年1月17日第11版（學習強國平台轉載）。
肖鵬：《财政支出标準化：理論框架、實施現狀與路徑選擇》《經濟研究參考》，2021年第10期，第9-23頁。
馬海濤、肖鵬：《做好财政政策加減乘除法 助力新發展格局下高質量發展——解讀2021年财政預算報告》《财政監督》，2021年第7期，第11-13頁。
肖鵬：《強化預算統籌能力 提升财政對國家戰略規劃的支撐保障》《光明網-理論頻道-實踐新論》，2021年11月30日（https://share.gmw.cn/theory/2021-11/30/content_35347227.htm）
肖鵬：《破難題 增動力，進一步深化預算管理制度改革》《光明網-理論頻道-專家學者看兩會》，2022年3月2日（https://share.gmw.cn/theory/2022-03/02/content_35557313.htm）
肖鵬、樊蓉：《地方财政透明度對财政預決算偏離度的影響分析》《bevictor伟德官网學報》，2021年第3期，第5-16頁（被《新華文摘》2021年第14期論點摘編收錄、人大複印資料《财政與稅務》2021年第7期全文轉載）。
衛舒羽、肖鵬：《稅收優惠,财政補貼與企業研發投入--基于滬深A股上市公司的實證分析》《稅務研究》，2021年第5期，第42-48頁。
陳凱、肖鵬：《财政分權、地方政府競争與技術創新——基于277個地級市的空間計量分析》《中國科技論壇》，2021年第2期，第74-84頁。
陳凱、肖鵬：《中期支出框架是否降低了宏觀經濟波動?——基于跨國數據的實證分析》《經濟問題探索》，2021年第2期，第5-16頁。
馬海濤、肖鵬：《國家治理能力提升背景下财政監督體系構建研究》《行政管理改革》，2020年第12期，第31-36頁。
肖鵬、樊蓉：《新時代地方人大部門預算審查監督現狀與提升》《财政科學》，2019年第11期，第21-29頁。
肖鵬、樊蓉：《債務控制視角的地方财政透明度研究——基于2009-2015年30個省級政府的實證分析》《财政研究》，2019年第7期，第60-70頁。
肖鵬、譚錫真：《财政轉移支付對地方财政努力度的影響——基于山東省的實證分析》《山東财經大學學報》，2019年第1期，第26-35頁。
陳凱、肖鵬.2019.預算績效目标管理的國際比較與啟示——基于目标設置理論的研究視角，經濟研究參考，12：68-78.
肖鵬、侯思佳：《專項轉移支付對地方教育供給的效應研究——基于31個省級面闆數據的實證分析》《江淮論壇》，2018年第5期，第181-186頁。
馬海濤、肖鵬：《預算項目支出标準體系建設研究——基于成本效益分析視角》《經濟研究參考》，2018年第3期，第3-10頁。
肖鵬、陳凱：《地方政府債務納入中期财政規劃管理的效應研究——基于美國州政府的檢驗》《财政研究》，2017年第9期，第14-26頁。
馬海濤，肖鵬：《國庫現金流量預測研究文獻綜述》《經濟研究參考》，2016年第31期，第4-10頁。
肖鵬，劉炳辰：《财政分權促進了城投債規模擴張嗎?——來自中國的省級面闆證據》《江淮論壇》，2017年第1期，第64-72頁。
肖鵬，刁曉紅：《營業稅改增值稅對CPI的影響的實證分析——基于上海市的樣本分析》《财政研究》，2016年第4期，第82-92頁。
肖鵬，劉炳辰：《财政透明度的提升縮小了政府性債務規模嗎？——來自中國29個省的證據》《bevictor伟德官网學報》，2015年第8期，第20-28頁。
肖鵬，張秀群：《财政投資對私人投資的擠出效應分析——基于中國1981-2012年數據的實證檢驗》《财政研究》，2014年第9期，第57-60頁。
肖鵬，閻川：《中國财政透明度提升的驅動因素與路徑選擇研究——基于Panel Data的28個省級數據的實證分析》《經濟社會體制比較》，2013年第4期，第205-212頁。
楊華，肖鵬：《日本解決地方财政困境的改革措施與啟示》《經濟理論與經濟管理》，2011年第10期，第98-104頁。
肖鵬，黎一璇：《所得稅稅收減免與企業研發支出關系的協整分析——基于全國54個國家級高新區的實證研究》《bevictor伟德官网學報》，2011年第8期，第15-19頁。
肖鵬，李燕：《基于luder政府會計環境評估模型的中國财政透明度研究》《公共行政評論》，2011年第4期，第140-157頁。
肖鵬，李燕：《預算透明：環境基礎、動力機制與提升路徑》《财貿經濟》，2011年第1期，第23-27頁。
楊華，肖鵬：《日本政府會計改革的經驗與啟示》《中國行政管理》，2012年第4期，第93-96頁。
肖鵬：《預算透明：理念、動力機制與提升路徑》《财政研究》，2010年第12期，第50-52頁。
肖鵬：《基于防範财政風險視角的政府會計改革研究》《會計研究》，2010年第6期，第22-27頁（人大複印資料《财務與會計》2010年第9期全文收錄）。
肖鵬，吳永紅：《企業研發投入的稅收優惠政策差異：國際經驗與啟示》《改革》，2009年第4期，第93-99頁。
科研項目:
主持：研究闡釋黨的十九屆五中全會精神國家社科基金重大項目《深化預算管理制度改革研究》（立項号：21ZDA043），2021年3月-2023年12月。
主持：國家糧食和物資儲備局《預算安排調節機制研究》，2023年10月-12月。
主持：财政部辦公廳《中國特色财政的國際比較研究》，2023年6月-12月。
主持：北京市人大預算監督研究基地建設，2023年7月-12月。
主持：北京市昌平區人大财經監督研究基地建設，2023年9月-2024年12月。
主持：北京市财政局《增強收支平衡可持續性 更好發揮财政職能作用》，2023年5月-7月。
參與：财政部财稅改革專家工作室《建立健全财政資金直達機制研究》，2020年10月-12月。
主持：财政部行政政法司《公務支出标準動态調整機制研究》，2022年3月-11月。
主持：财政部國庫司《關于完善國家金庫管理體制的研究》，2021年3月-11月。
主持：廣西壯族自治區人大常委會《廣西财政預算項目支出定額标準體系建設研究》，2020年7月-12月。
主持：中國發展研究基金會《全面預算績效管理讀本》，2019年6月-2020年5月。
主持：全國預算與會計研究會《地方國庫現金管理高質量發展研究》，2019年6月-12月。
主持：北京市發展和改革委員會《均等化目标下的北京市基本公共服務清單财力保障機制研究》，2017年4月-2017年12月。
參與：世行“财政與國家治理”技援項目《現代财政資金收支運行機制研究》，2020年3月-12月。
主持：世行“财政與國家治理”技援項目“政府綜合财務報告制度及國庫管理相關問題研究”子項目《國庫現金流量預測體系建設——按日預測體系建設研究》，2018年3月-12月。
參與：亞行項目《支持河南省公共部門改革研究——項目支出基準體系建設研究》，任項目組副組長，2018年9月-2019年12月。
主持：中國發展研究基金會項目《國外預算績效目标管理曆程、制度框架與啟示》,2017年3月-2018年3月。
主持：國家社科基金項目《中國财政透明度提升的環境驅動因素與“度”的衡量研究》，項目編号：13CJY113），2013年6月-2016年12月。
主持：北京市哲學社會科學規劃項目《财政信息公開的驅動因素與效應研究——基于北京市現實》，項目編号：12KDB013，2012年7月-2015年3月。
主持：北京市哲學社科規劃項目《跨年度預算平衡機制構建與北京市引入中期預算管理研究》，項目編号：15JGB108，2015年7月-2017年3月。
主持：财政部省部共建課題《現代财政制度下的财政監督理論與制度創新》，2017年3月-12月。
主持：财政部預算評審中心《國外預算支出标準編譯》，2016年7月-2017年3月。
主持：中信銀行股份有限公司《中央地方國庫現金管理及财政管理研究》，2016年1月-2017年12月。
主持：中國發展研究基金會《中國新型城鎮化進程中的PPP項目試點與評估》，2015年6月-12月。
主持：畢馬威會計師事務所《政府會計準則的實施機制研究》，2015年6月-12月。
參與：國家社科基金重點項目（子課題負責人）《現代預算制度構建研究》（資助号：14AZD022），2014年3月-2016年12月。
參與：bevictor伟德官网重大基礎研究科研課題培育項目（子課題負責人）《國家治理能力提升下的政府施政行為規範研究》，2014年3月-2016年12月。
主持：教育部人文社科青年項目《所得稅稅率優惠與企業研發支出的關系，基于Panel Data的全國54個國家級高新區的實證研究》，項目編号：09YJC790272，2009年6月-2011年12月。
主持：黑龍江省人大預算工作委員會委托項目《政府間事權與支出責任劃分研究——基于黑龍江的案例研究》，2014年5月-2014年8月。
主持：北京市預算會計研究會委托項目《完善北京市國有資本經營預算制度研究》，2014年4月-10月。
主持：中國國際經濟交流中心《綠色經濟發展模式研究》，2010年3月-12月。
主持：北京用友政務軟件公司《财政管理理論與實踐創新研究》，2011年3月-2012年3月。
